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- Les acteurs du réseau
Le CEEVEC réseau Azur-Provence fédère aujourd’hui 40 équipes dans 20 centres (CRCM, C3M, iBV, IMM, IRCAN, CiNAM, IBDM, ISA, IPMC, C2VN, UNIS, INT, CRCL, INRAE, AFMB, INMED, LAI, MeliS, INP, LISM).
Ces équipes couvrent un large spectre d’expertises, allant de la biologie fondamentale aux approches cliniques et translationnelles.
Le CEEVEC s’appuie sur plusieurs plateformes technologiques réparties sur le territoire.
La plateforme propose une expertise internationale sur la détection des vésicules extracellulaires par cytométrie en flux, avec une démarche d’accompagnement technologique pour une caractérisation optimale de ces biomarqueurs biologiques. Elle poursuit les travaux d’optimisation et de R&D sur ce paramètre.
En parallèle, AMUTICYT propose des phénotypages cellulaires humains et murins, jusqu’à 21 paramètres, du tri cellulaire et vésiculaire, de la cytométrie d’image en flux (unique sur Marseille).
Elle est ouverte en prestation de service à l’ensemble de la communauté académique locale, nationale et internationale mais aussi au monde socio-économique.
Le service d’Imagerie Cellulaire et de Cytométrie en flux de l’IPMC, membre fondateur de la plateforme MICA labellisée IBiSA, met à disposition des équipements de pointe en microscopie et cytométrie, associée à une expertise en analyse d’images et de données pour la communauté scientifique. Nous proposons une approche intégrée de l’étude des vésicules et petites particules, combinant cytométrie spectrale avancée (Cytek Aurora équipé d’un module vESP), optimisation des échantillons et technique de microscopie à super-résolution (Leica SP8 STED).
La plateforme MaP-CRCM, située au Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), est spécialisée dans l’analyse protéomique par spectrométrie de masse. Elle met son expertise à disposition des laboratoires de recherche publics et privés pour l’identification, la caractérisation et la quantification des protéines. Ses domaines d’expertise comprennent notamment : l’analyse de protéomes complexes et l’identification de protéines, la quantification relative des protéines, la caractérisation des modifications post-traductionnelles, l’identification et la caractérisation de complexes protéiques, l’analyse de sécrétomes, matrisomes et vésicules extracellulaires.
Équipée de spectromètres de masse de dernière génération, MaP-CRCM contribue aux projets du CEEVEC nécessitant une caractérisation protéomique sensible et approfondie des vésicules extracellulaires et d’échantillons complexes en faibles quantités.
La plateforme d’analyse des biomolécules (PAB-Azur), située à l’Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Sophia Antipolis, est spécialisée dans la caractérisation des biomolécules par spectrométrie de masse. PAB-Azur met son expertise à disposition de la communauté scientifique élargie, incluant des laboratoires publics et privés, dans les vastes domaines de la biologie et de la chimie. L’un de ses domaines d’expertise concerne l’analyse protéomique, notamment :
La plateforme PAB-Azur-lipidomique, spécialisée en métabolomique et lipidomique, met en œuvre des technologies avancées de spectrométrie de masse pour caractériser les petites molécules et les lipides dans des matrices biologiques complexes. Elle développe des approches innovantes pour explorer les mécanismes biologiques et soutenir des projets de recherche en santé, environnement et biotechnologies.
La plateforme de Microscopie Électronique de l’Institut de Biologie du Développement de Marseille est ouverte aux utilisateurs du CEEVEC qui souhaitent observer l’ultrastructure de leurs préparations d’EVs par la technique de coloration négative. Nous pouvons également réaliser des expériences d’enrobage et/ou d’immunomarquage pour localiser une molécule d’intérêt à l’intérieur ou sur les vésicules extra-cellulaires.
Au-delà de cette compétence en préparation de grilles de vésicules extra-cellulaires, la plateforme peut aussi préparer des échantillons de cellules in vitro ou de tissus pour l’observation par microscopie électronique 2D et 3D à haute résolution (Tomo-TEM) ou sur de grands volumes (SBF-SEM).
Pour en savoir plus et nous contacter : https://www.ibdm.univ-amu.fr/team/electron-microscopy/